Description du sujet de thèse
Domaine
Défis technologiques
Sujets de thèse
Détection d'oeufs de parasites par imagerie sans lentilles grand champ assistée par intelligence artificielle
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Dans la plupart des cycles parasitaires, la phase libre passe par un stade d'œuf, qui est libéré par l'hôte dans l'environnement via une matrice fécale complexe, qui présente des concentrations d'œufs très variables et souvent faibles. La méthode de détection classique repose sur l'observation microscopique de ces œufs, ce qui implique une préparation fastidieuse et longue de l'échantillon pour concentrer les œufs, avec des valeurs de sensibilité très variables. Cette détection est cruciale car une fois dispersés, les œufs contaminent l'environnement et les denrées alimentaires, entraînant des cas de zoonoses parasitaires chez l'homme.
La détection dans les matrices environnementales et alimentaires est encore plus complexe que pour les matières fécales en raison du très faible nombre d'œufs présents : 1 à 10 par échantillon dans la grande majorité des cas. La thèse vise à développer un système d'imagerie sans lentille grand champ, qui permettra de compter et d'identifier des œufs de parasites dans des matrices complexes, tout en augmentant la sensibilité. Cela permettra d'automatiser la détection, ouvrant ainsi des perspectives d'investigation sur un plus grand nombre d'échantillons, pour une meilleure veille sanitaire.
Université / école doctorale
Université Paris-Est
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
biotechnologies imagerie biomédicale traitement de l'image
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2025
Personne à contacter par le candidat
MARCOUX Pierre R. < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRT/DTIS
DTIS, bât. 42
CEA - LETI MINATEC
17, rue des Martyrs
F-38054 Grenoble cedex 9
04 38 78 15 04
Tuteur / Responsable de thèse
KARADJIAN Grégory < email supprimé pour raison de sécurité >
ANSES
Laboratoire de Santé Animale, UMR biologie moléculaire et immunologie parasitaire
ANSES
14 rue Pierre et Marie Curie
94701 Maisons-Alfort cedex
0149772818
En savoir plus
https://orcid.org/0000-0003-3855-9662
https://www.leti-cea.fr
https://fr.linkedin.com/in/pierre-r-marcoux-9a415717
Domaine
Défis technologiques
Sujets de thèse
Détection d'oeufs de parasites par imagerie sans lentilles grand champ assistée par intelligence artificielle
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Dans la plupart des cycles parasitaires, la phase libre passe par un stade d'œuf, qui est libéré par l'hôte dans l'environnement via une matrice fécale complexe, qui présente des concentrations d'œufs très variables et souvent faibles. La méthode de détection classique repose sur l'observation microscopique de ces œufs, ce qui implique une préparation fastidieuse et longue de l'échantillon pour concentrer les œufs, avec des valeurs de sensibilité très variables. Cette détection est cruciale car une fois dispersés, les œufs contaminent l'environnement et les denrées alimentaires, entraînant des cas de zoonoses parasitaires chez l'homme.
La détection dans les matrices environnementales et alimentaires est encore plus complexe que pour les matières fécales en raison du très faible nombre d'œufs présents : 1 à 10 par échantillon dans la grande majorité des cas. La thèse vise à développer un système d'imagerie sans lentille grand champ, qui permettra de compter et d'identifier des œufs de parasites dans des matrices complexes, tout en augmentant la sensibilité. Cela permettra d'automatiser la détection, ouvrant ainsi des perspectives d'investigation sur un plus grand nombre d'échantillons, pour une meilleure veille sanitaire.
Université / école doctorale
Université Paris-Est
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
biotechnologies imagerie biomédicale traitement de l'image
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2025
Personne à contacter par le candidat
MARCOUX Pierre R. < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRT/DTIS
DTIS, bât. 42
CEA - LETI MINATEC
17, rue des Martyrs
F-38054 Grenoble cedex 9
04 38 78 15 04
Tuteur / Responsable de thèse
KARADJIAN Grégory < email supprimé pour raison de sécurité >
ANSES
Laboratoire de Santé Animale, UMR biologie moléculaire et immunologie parasitaire
ANSES
14 rue Pierre et Marie Curie
94701 Maisons-Alfort cedex
0149772818
En savoir plus
https://orcid.org/0000-0003-3855-9662
https://www.leti-cea.fr
https://fr.linkedin.com/in/pierre-r-marcoux-9a415717
