Description du sujet de thèse
Domaine
Défis technologiques
Sujets de thèse
Nouvel outil de diagnostic rapide pour la septicémie : biopuce microfluidique pour la détection multicible par amplification isotherme
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Le sepsis est l'une des principales causes de mortalité dans le monde qui résulte généralement d'une infection bactérienne mais peut être aussi causé par des virus, des champignons ou des parasites. Un diagnostic rapide est essentiel pour une prise en charge efficace et augmenter les chances de survie du patient. Il existe des solutions commerciales de détection d'acides nucléiques par qPCR capable de détecter plusieurs cibles. Cependant ces techniques sont limitées par le nombre de canaux de fluorescence disponible sur l'instrument ou par le nombre de chambre de lecture. Ces techniques d'amorces LAMP (amplification isotherme en temps réel) spécifiques sur un support solide tel que le COC ou le verre.
Les résultats attendus sont l'élaboration d'une biopuce permettant de détecter en temps réel et en quelques minutes fragmentent l'échantillon pour pouvoir être multiplexe, ce qui conduit à une perte de sensibilité.
Pour répondre à la question : comment détecter plusieurs cibles sans perdre en sensibilité ? Le doctorant devra réaliser dans une unique chambre réactionnelle, une détection multiplexe par régionalisation plusieurs ADN cibles, comprenant : le design et le choix des amorces, l'immobilisation des amorces par fonctionnalisation de surface, l'intégration en carte micro fluidique et le traitement des données pour la détection par fluorescence de sondes spécifiques des cibles.
Cette innovation technologique, permettra au doctorant d'acquérir de solides compétences dans divers domaines tels que la biologie moléculaire, la fonctionnalisation de surface, la modélisation et la simulation tout en s'inscrivant dans une équipe pluridisciplinaire.
Université / école doctorale
Ecole Doctorale de Physique de Grenoble (EdPHYS)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
Matériaux/nanobiotechnologies
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2025
Personne à contacter par le candidat
BACQUE Mélissa < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRT/DTIS//LSMB
DTIS, bât. 42
CEA - LETI MINATEC
17, rue des Martyrs
F-38054 Grenoble cedex 9
04 38 78 14 08
Tuteur / Responsable de thèse
BUHOT Arnaud < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRF/IRIG//SYMMES
IRIG, SyMMES, CREAB
CEA Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 Grenoble cedex 9
04 38 78 38 68
En savoir plus
Domaine
Défis technologiques
Sujets de thèse
Nouvel outil de diagnostic rapide pour la septicémie : biopuce microfluidique pour la détection multicible par amplification isotherme
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Le sepsis est l'une des principales causes de mortalité dans le monde qui résulte généralement d'une infection bactérienne mais peut être aussi causé par des virus, des champignons ou des parasites. Un diagnostic rapide est essentiel pour une prise en charge efficace et augmenter les chances de survie du patient. Il existe des solutions commerciales de détection d'acides nucléiques par qPCR capable de détecter plusieurs cibles. Cependant ces techniques sont limitées par le nombre de canaux de fluorescence disponible sur l'instrument ou par le nombre de chambre de lecture. Ces techniques d'amorces LAMP (amplification isotherme en temps réel) spécifiques sur un support solide tel que le COC ou le verre.
Les résultats attendus sont l'élaboration d'une biopuce permettant de détecter en temps réel et en quelques minutes fragmentent l'échantillon pour pouvoir être multiplexe, ce qui conduit à une perte de sensibilité.
Pour répondre à la question : comment détecter plusieurs cibles sans perdre en sensibilité ? Le doctorant devra réaliser dans une unique chambre réactionnelle, une détection multiplexe par régionalisation plusieurs ADN cibles, comprenant : le design et le choix des amorces, l'immobilisation des amorces par fonctionnalisation de surface, l'intégration en carte micro fluidique et le traitement des données pour la détection par fluorescence de sondes spécifiques des cibles.
Cette innovation technologique, permettra au doctorant d'acquérir de solides compétences dans divers domaines tels que la biologie moléculaire, la fonctionnalisation de surface, la modélisation et la simulation tout en s'inscrivant dans une équipe pluridisciplinaire.
Université / école doctorale
Ecole Doctorale de Physique de Grenoble (EdPHYS)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
Matériaux/nanobiotechnologies
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2025
Personne à contacter par le candidat
BACQUE Mélissa < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRT/DTIS//LSMB
DTIS, bât. 42
CEA - LETI MINATEC
17, rue des Martyrs
F-38054 Grenoble cedex 9
04 38 78 14 08
Tuteur / Responsable de thèse
BUHOT Arnaud < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRF/IRIG//SYMMES
IRIG, SyMMES, CREAB
CEA Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 Grenoble cedex 9
04 38 78 38 68
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