Description du sujet de thèse
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
Origines et évolution des protéines de type prion (PrLP) chez les eucaryotes
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Initialement associées aux maladies neurodégénératives, les protéines de type prion (PrLP) sont aujourd'hui reconnues comme des acteurs physiologiques majeurs de la plasticité cellulaire et de la réponse au stress. Ces protéines possèdent souvent un domaine intrinsèquement désordonné riche en glutamine et asparagine, dit prion-like domain (PrLD), capable de basculer entre états solubles, condensés ou amyloïdes. Des exemples emblématiques incluent CPEB chez l'Aplysie, impliquée dans la mémoire synaptique, MAVS dans la réponse antivirale, MED15 et FUS dans la régulation transcriptionnelle et la dynamique des condensats nucléocytoplasmiques, ou encore ELF3 chez les plantes, dont la polymérisation amyloïde contrôle la floraison et la photopériode. Chez les champignons, les protéines Sup35, Ure2p et HET-s constituent des modèles expérimentaux de prions fonctionnels, montrant que l'agrégation réversible peut servir de mécanisme de régulation ou d'adaptation. Ces transitions conformationnelles sont désormais perçues comme des réponses adaptatives, et non comme des dérives pathologiques. Cette thèse vise à retracer l'origine et la diversification des protéines de type prion à l'échelle des eucaryotes, en testant l'hypothèse selon laquelle les grandes crises paléoclimatiques ont favorisé l'apparition et la duplication de gènes codant des domaines PrLD via l'expansion de microsatellites et l'activité des éléments transposables. Le projet combinera analyses phylogénomiques, détection de domaines PrLD et modélisation des pressions de sélection, afin de cartographier les grandes étapes de l'évolution fonctionnelle des PrLP et leur lien avec la tolérance au stress.
Université / école doctorale
Structure et Dynamique des Systèmes Vivants (SDSV)
Paris-Saclay
Localisation du sujet de thèse
Site
Fontenay-aux-Roses
Critères candidat
Formation recommandée
Génomique, biologie évolutive, bioinformatique, statisques
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2026
Personne à contacter par le candidat
COMOY Emmanuel < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DSV/IMETI/SEPIA/L4PA
18 route du panorama
01 46 54 90 05
Tuteur / Responsable de thèse
MADOUI Amin < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRF/JACOB
18 Route du Panorama
92265 Fontenay-aux-Roses
0146548105
En savoir plus
https://madoui.github.io/
https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/SEPIA.aspx
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
Origines et évolution des protéines de type prion (PrLP) chez les eucaryotes
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Initialement associées aux maladies neurodégénératives, les protéines de type prion (PrLP) sont aujourd'hui reconnues comme des acteurs physiologiques majeurs de la plasticité cellulaire et de la réponse au stress. Ces protéines possèdent souvent un domaine intrinsèquement désordonné riche en glutamine et asparagine, dit prion-like domain (PrLD), capable de basculer entre états solubles, condensés ou amyloïdes. Des exemples emblématiques incluent CPEB chez l'Aplysie, impliquée dans la mémoire synaptique, MAVS dans la réponse antivirale, MED15 et FUS dans la régulation transcriptionnelle et la dynamique des condensats nucléocytoplasmiques, ou encore ELF3 chez les plantes, dont la polymérisation amyloïde contrôle la floraison et la photopériode. Chez les champignons, les protéines Sup35, Ure2p et HET-s constituent des modèles expérimentaux de prions fonctionnels, montrant que l'agrégation réversible peut servir de mécanisme de régulation ou d'adaptation. Ces transitions conformationnelles sont désormais perçues comme des réponses adaptatives, et non comme des dérives pathologiques. Cette thèse vise à retracer l'origine et la diversification des protéines de type prion à l'échelle des eucaryotes, en testant l'hypothèse selon laquelle les grandes crises paléoclimatiques ont favorisé l'apparition et la duplication de gènes codant des domaines PrLD via l'expansion de microsatellites et l'activité des éléments transposables. Le projet combinera analyses phylogénomiques, détection de domaines PrLD et modélisation des pressions de sélection, afin de cartographier les grandes étapes de l'évolution fonctionnelle des PrLP et leur lien avec la tolérance au stress.
Université / école doctorale
Structure et Dynamique des Systèmes Vivants (SDSV)
Paris-Saclay
Localisation du sujet de thèse
Site
Fontenay-aux-Roses
Critères candidat
Formation recommandée
Génomique, biologie évolutive, bioinformatique, statisques
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2026
Personne à contacter par le candidat
COMOY Emmanuel < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DSV/IMETI/SEPIA/L4PA
18 route du panorama
01 46 54 90 05
Tuteur / Responsable de thèse
MADOUI Amin < email supprimé pour raison de sécurité >
CEA
DRF/JACOB
18 Route du Panorama
92265 Fontenay-aux-Roses
0146548105
En savoir plus
https://madoui.github.io/
https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/SEPIA.aspx
