Description du sujet de thèse
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
PtSeipin: un pont entre biogenèse et dégradation des gouttelettes lipidiques chez la diatomée Phaeodactylum tricornutum
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Les microalgues regroupent une grande diversité d'organismes et suscitent un intérêt croissant en raison de leur capacité à produire des biomolécules d'intérêt industriel et biotechnologique. En particulier, elles peuvent accumuler de l'huile sous forme de gouttelettes lipidiques (LD, lipid droplets) en réponse à des stress abiotiques tels que la carence en azote. Cette accumulation d'huile représente un fort potentiel pour la production de biocarburants.
Nous avons récemment montré que l'inactivation du gène codant la Seipine, une protéine impliquée dans la biogenèse des LD, entraîne une forte accumulation d'huile chez la diatomée Phaeodactylum tricornutum. De plus, cette accumulation semble liée à une absence de dégradation des LD dans les mutants dépourvus de Seipine. Ces résultats suggèrent que, chez cette diatomée, les LD sont programmées pour être dégradées dès leur formation et que l'inhibition de la dégradation pourrait être une stratégie intéressante pour augmenter la production d'huile. Le présent projet vise à élucider les mécanismes de dégradation des LD et, plus particulièrement, les liens entre leur biogenèse et leur dégradation, ce qui permettra d'identifierde nouvelles cibles d'intérêt. Trois axes principaux seront développés :
1.Identifier les partenaires de PtSeipine impliqués dans la dégradation des LD, en combinant une approche ciblée (protéines candidates) et une approche globale (sans a priori).
2.Déterminer les mécanismes de dégradation des LD altérés dans les mutants PtSeipin KO, en combinant des observations en microscopie électronique avec des analyses transcriptomiques et protéomiques.
3.Comprendre l'utilisation que les microalgues font de l'huile lors de la phase de sortie de stress, à l'aide d'approches de fluxomique.
Université / école doctorale
Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
master in plant biology or biotechnology
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2026
Personne à contacter par le candidat
Salvaing Juliette < email supprimé pour raison de sécurité >
INRAE/UMR1417
LPCV/Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale
CEA Grenoble
17 rue des martyrs
38054 Grenoble cedex 9
0438784477
Tuteur / Responsable de thèse
Salvaing Juliette < email supprimé pour raison de sécurité >
INRAE/UMR1417
LPCV/Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale
CEA Grenoble
17 rue des martyrs
38054 Grenoble cedex 9
0438784477
En savoir plus
https://www.lpcv.fr/Pages/Lipid/Presentation.aspx
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
PtSeipin: un pont entre biogenèse et dégradation des gouttelettes lipidiques chez la diatomée Phaeodactylum tricornutum
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Les microalgues regroupent une grande diversité d'organismes et suscitent un intérêt croissant en raison de leur capacité à produire des biomolécules d'intérêt industriel et biotechnologique. En particulier, elles peuvent accumuler de l'huile sous forme de gouttelettes lipidiques (LD, lipid droplets) en réponse à des stress abiotiques tels que la carence en azote. Cette accumulation d'huile représente un fort potentiel pour la production de biocarburants.
Nous avons récemment montré que l'inactivation du gène codant la Seipine, une protéine impliquée dans la biogenèse des LD, entraîne une forte accumulation d'huile chez la diatomée Phaeodactylum tricornutum. De plus, cette accumulation semble liée à une absence de dégradation des LD dans les mutants dépourvus de Seipine. Ces résultats suggèrent que, chez cette diatomée, les LD sont programmées pour être dégradées dès leur formation et que l'inhibition de la dégradation pourrait être une stratégie intéressante pour augmenter la production d'huile. Le présent projet vise à élucider les mécanismes de dégradation des LD et, plus particulièrement, les liens entre leur biogenèse et leur dégradation, ce qui permettra d'identifierde nouvelles cibles d'intérêt. Trois axes principaux seront développés :
1.Identifier les partenaires de PtSeipine impliqués dans la dégradation des LD, en combinant une approche ciblée (protéines candidates) et une approche globale (sans a priori).
2.Déterminer les mécanismes de dégradation des LD altérés dans les mutants PtSeipin KO, en combinant des observations en microscopie électronique avec des analyses transcriptomiques et protéomiques.
3.Comprendre l'utilisation que les microalgues font de l'huile lors de la phase de sortie de stress, à l'aide d'approches de fluxomique.
Université / école doctorale
Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
master in plant biology or biotechnology
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2026
Personne à contacter par le candidat
Salvaing Juliette < email supprimé pour raison de sécurité >
INRAE/UMR1417
LPCV/Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale
CEA Grenoble
17 rue des martyrs
38054 Grenoble cedex 9
0438784477
Tuteur / Responsable de thèse
Salvaing Juliette < email supprimé pour raison de sécurité >
INRAE/UMR1417
LPCV/Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale
CEA Grenoble
17 rue des martyrs
38054 Grenoble cedex 9
0438784477
En savoir plus
https://www.lpcv.fr/Pages/Lipid/Presentation.aspx
