Description du poste
Domaine
Sciences du vivant
Contrat
Stage
Intitulé de l'offre
Stagiaire en biologie moléculaire et microbiologie H/F H/F
Sujet de stage
Le projet DYNAMO-RNAP s'appuie sur CREPE, notre plateforme propriétaire d'édition génomique à haut débit basée sur CRISPR-Cas9, ainsi que sur des systèmes automatisés de culture continue et le séquençage de nouvelle génération (NGS), afin de générer une cartographie complète de l'impact des mutations, à la résolution d'un résidu, sur la fonction de l'ARN polymérase. L'étudiant(e) de Master 2 sélectionné(e) jouera un rôle central dans le déploiement à grande échelle de cette approche de Deep Mutational Scanning (DMS) afin de décrypter de manière systématique les interactions allostériques au sein de l'ARN polymérase.
Durée du contrat (en mois)
6
Description de l'offre
Les principales missions seront les suivantes :
Clonage à haut débit et génération de banques de mutants : construire des banques exhaustives de mutations génomiques localisées et sans cicatrice (scarless) chez Escherichia coli.
Sélection automatisée : utiliser des turbidostats de culture continue de dernière génération afin de réaliser des expériences de compétition parallélisées dans des conditions contrôlées de carence nutritionnelle et/ou de stress.
Séquençage profond génotype-phénotype : préparer et analyser des banques de séquençage d'amplicons à grande échelle (Illumina NovaSeq) afin de suivre l'évolution de la fréquence des variants au cours du temps.
Modélisation intégrative des données : exploiter Python (Pandas, Matplotlib/Seaborn) ainsi que des outils d'analyse structurale afin de comprendre l'impact des mutations sur la fonction de l'ARN polymérase.
Profil du candidat
Nous recherchons un(e) étudiant(e) ambitieux(se) et très motivé(e), actuellement inscrit(e) en Master 2 ou en école d'ingénieurs, avec une spécialisation en biologie des systèmes, biologie synthétique, microbiologie moléculaire, bio-ingénierie ou biotechnologies.
Compétences recherchées :
Compétences techniques (souhaitées, une formation sera assurée) : expérience pratique des techniques de base en biologie moléculaire (PCR, assemblage Gibson, transformation bactérienne).
Compétences en analyse de données : une connaissance de Python et/ou R pour le traitement de données constitue un atout.
Langues : bonne maîtrise du français et de l'anglais.
Pour toute information complémentaire, veuillez contacter :
Alaksh Choudhury
< e-mail verwijderd om veiligheidsredenen >
Localisation du poste
Site
Autre
Localisation du poste
France, Ile-de-France, Essonne (91)
Ville
EVRY
Critères candidat
Langues
Anglais (Courant)
Diplôme préparé
Bac+5 - Master 2
Formation recommandée
MASTER 2 ou Ecole Ingénieurs
Possibilité de poursuite en thèse
Non
Demandeur
Disponibilité du poste
01/02/2027
Domaine
Sciences du vivant
Contrat
Stage
Intitulé de l'offre
Stagiaire en biologie moléculaire et microbiologie H/F H/F
Sujet de stage
Le projet DYNAMO-RNAP s'appuie sur CREPE, notre plateforme propriétaire d'édition génomique à haut débit basée sur CRISPR-Cas9, ainsi que sur des systèmes automatisés de culture continue et le séquençage de nouvelle génération (NGS), afin de générer une cartographie complète de l'impact des mutations, à la résolution d'un résidu, sur la fonction de l'ARN polymérase. L'étudiant(e) de Master 2 sélectionné(e) jouera un rôle central dans le déploiement à grande échelle de cette approche de Deep Mutational Scanning (DMS) afin de décrypter de manière systématique les interactions allostériques au sein de l'ARN polymérase.
Durée du contrat (en mois)
6
Description de l'offre
Les principales missions seront les suivantes :
Clonage à haut débit et génération de banques de mutants : construire des banques exhaustives de mutations génomiques localisées et sans cicatrice (scarless) chez Escherichia coli.
Sélection automatisée : utiliser des turbidostats de culture continue de dernière génération afin de réaliser des expériences de compétition parallélisées dans des conditions contrôlées de carence nutritionnelle et/ou de stress.
Séquençage profond génotype-phénotype : préparer et analyser des banques de séquençage d'amplicons à grande échelle (Illumina NovaSeq) afin de suivre l'évolution de la fréquence des variants au cours du temps.
Modélisation intégrative des données : exploiter Python (Pandas, Matplotlib/Seaborn) ainsi que des outils d'analyse structurale afin de comprendre l'impact des mutations sur la fonction de l'ARN polymérase.
Profil du candidat
Nous recherchons un(e) étudiant(e) ambitieux(se) et très motivé(e), actuellement inscrit(e) en Master 2 ou en école d'ingénieurs, avec une spécialisation en biologie des systèmes, biologie synthétique, microbiologie moléculaire, bio-ingénierie ou biotechnologies.
Compétences recherchées :
Compétences techniques (souhaitées, une formation sera assurée) : expérience pratique des techniques de base en biologie moléculaire (PCR, assemblage Gibson, transformation bactérienne).
Compétences en analyse de données : une connaissance de Python et/ou R pour le traitement de données constitue un atout.
Langues : bonne maîtrise du français et de l'anglais.
Pour toute information complémentaire, veuillez contacter :
Alaksh Choudhury
< e-mail verwijderd om veiligheidsredenen >
Localisation du poste
Site
Autre
Localisation du poste
France, Ile-de-France, Essonne (91)
Ville
EVRY
Critères candidat
Langues
Anglais (Courant)
Diplôme préparé
Bac+5 - Master 2
Formation recommandée
MASTER 2 ou Ecole Ingénieurs
Possibilité de poursuite en thèse
Non
Demandeur
Disponibilité du poste
01/02/2027
