Sujet du stage : Variabilité génétique de la fertilité du maïs sous stress thermique chaud
La souveraineté de la production de semences de maïs en France dépend de la production de semences de bonne qualité et en quantité suffisante. Ce stage s’inscrit dans le cadre d’un projet national visant à fournir aux sélectionneurs de maïs des outils génétiques afin d’assurer la production de semences de haute qualité dans le contexte du changement climatique. Une évaluation de la tolérance au stress thermique chaud à la floraison sera réalisée sur un panel diversifié de 240 lignées de maïs. Des traits liés à la fertilité mâle et femelle seront phénotypés sur ces lignées, incluant la faculté germinative du pollen, l’ASI (Anthesis-to-Silking Interval), le nombre de soies et la cinétique d’émission des soies. Le stress thermique chaud sera appliqué à la floraison dans une serre en conditions contrôlées. Dans le cadre du projet, les lignées seront génotypées afin de rechercher ultérieurement des QTL (Quantitative Trait Loci).
Les résultats attendus incluent une caractérisation de lignées européennes pour leur tolérance au stress thermique chaud, qui sera conduite en partie durant ce stage. Ces avancées permettront, en premier lieu, de mieux comprendre les déterminants génétiques de la tolérance à ce stress et d'améliorer la résilience des cultures de maïs face aux défis environnementaux, afin de sécuriser la production de semences.
OBJECTIF DU STAGE :
Participer au phénotypage des traits de fertilité mâle et femelle sur maïs en conditions contrôlées, analyser les données collectées sur le panel de lignées de maïs.
METHODES ENVISAGEES :
- Phénotypage incluant l’utilisation d’un algorithme d’analyse d’images développé en interne (pour le suivi de l’émission des soies ou pour le suivi de la floraison femelle) et la quantification de la germination du pollen in vitro au microscope.
- Analyse statistique des données collectées pour caractériser l’effet de la température, l’effet de la variabilité génétique sur les traits phénotypiques et leur interaction (sur R).
- Rédaction d’un rapport permettant l’utilisation des résultats du stage dans le projet. Présentation des travaux du stage aux partenaires du projet (INRAe).
PROFIL REQUIS :
- Étudiant(e) BAC+4 en Agronomie/ Agriculture, stage de césure
- Connaissances en agronomie générale et en physiologie végétale
- Intérêt pour l’analyse de données : maîtrise de Excel et R.
- Bonnes capacités rédactionnelles.
- Autonomie, prise d’initiative, bon relationnel, rigueur, curiosité.
- Langues : Français (courant) et Anglais (lecture)
Indemnité de stage en vigueur.
RESPONSABLES ARVALIS :
Brigitte Escale (Ingénieure R&D en Physiologie et Écophysiologie) et Alexia Crézé (Ingénieure R&D analyses génétiques).
Le ou la stagiaire sera co-encadré(e) par des technicien(nes) travaillant sur les essais.
Lieu du stage : ARVALIS - Institut du végétal - 21 chemin de Pau, 64121 MONTARDON
Merci d’envoyer votre candidature à l’adresse email suivante : < email slettet af sikkerhedsmæssige årsager >
