Description du sujet de thèse
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
Découverte guidée par V-SYNTHES d'inhibiteurs des bromodomaines BET : une nouvelle stratégie antifongique cilbant Candida auris
Contrat
Thèse
Description de l'offre
De nouvelles stratégies antifongiques sont aujourd'hui indispensables pour lutter contre Candida auris, un " superchampignon " émergent multirésistant, à l'origine d'épidémies nosocomiales sévères et d'infections à taux de mortalité élevé. Nos études de preuve de concept réalisées sur Candida albicans et Candida glabrata ont démontré que les bromodomaines BET fongiques - des modules de liaison à la chromatine reconnaissant les histones acétylées - constituent de nouvelles cibles antifongiques prometteuses. Nous avons mis au point un ensemble d'outils moléculaires et cellulaires pour accélérer la découverte d'inhibiteurs des bromodomaines BET fongiques, comprenant des essais FRET pour le criblage de composés, des souches de Candida humanisées pour la validation de la spécificité de cible, ainsi que des tests NanoBiT permettant de suivre directement l'inhibition des bromodomaines BET dans des cellules fongiques.
Ce projet de thèse marque la prochaine étape translationnelle de notre programme de recherche. Il exploitera l'approche V-SYNTHES, une stratégie innovante de découverte et de conception de nouvelles molécules thérapeutiques guidée par l'IA, afin de développer des inhibiteurs BET hautement puissants ciblant C. auris. Ces inhibiteurs seront caractérisés par des analyses biophysiques, biochimiques et cellulaires, étudiés en co-cristallographie avec leurs bromodomaines cibles, puis validés pour leur activité spécifique dans C. auris ainsi que pour leur efficacité antifongique dans des modèles animaux d'infection. Ils serviront également à explorer les mécanismes d'émergence de la résistance aux inhibiteurs BET. Ce projet allie une stratégie antifongique originale à une approche méthodologique innovante, offrant un cadre de formation unique à la recherche interdisciplinaire et translationnelle.
Université / école doctorale
Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
Master's
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2026
Personne à contacter par le candidat
PETOSA Carlo < email deleted for security reasons >
CNRS IBS
DRF/IRIG/DBSCI/IBS/EPIGEN
Institut de biologie structurale
Groupe 'Épigénétique et voies moléculaires'
71 Avenue des Martyrs, CS10090
38044 Grenoble cedex 9
0457428617
Tuteur / Responsable de thèse
PETOSA Carlo < email deleted for security reasons >
CNRS IBS
DRF/IRIG/DBSCI/IBS/EPIGEN
Institut de biologie structurale
Groupe 'Épigénétique et voies moléculaires'
71 Avenue des Martyrs, CS10090
38044 Grenoble cedex 9
0457428617
En savoir plus
https://www.ibs.fr/en/research/assembly-dynamics-and-reactivity/epigenetics-and-molecular-pathways-group-c-petosa
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
Découverte guidée par V-SYNTHES d'inhibiteurs des bromodomaines BET : une nouvelle stratégie antifongique cilbant Candida auris
Contrat
Thèse
Description de l'offre
De nouvelles stratégies antifongiques sont aujourd'hui indispensables pour lutter contre Candida auris, un " superchampignon " émergent multirésistant, à l'origine d'épidémies nosocomiales sévères et d'infections à taux de mortalité élevé. Nos études de preuve de concept réalisées sur Candida albicans et Candida glabrata ont démontré que les bromodomaines BET fongiques - des modules de liaison à la chromatine reconnaissant les histones acétylées - constituent de nouvelles cibles antifongiques prometteuses. Nous avons mis au point un ensemble d'outils moléculaires et cellulaires pour accélérer la découverte d'inhibiteurs des bromodomaines BET fongiques, comprenant des essais FRET pour le criblage de composés, des souches de Candida humanisées pour la validation de la spécificité de cible, ainsi que des tests NanoBiT permettant de suivre directement l'inhibition des bromodomaines BET dans des cellules fongiques.
Ce projet de thèse marque la prochaine étape translationnelle de notre programme de recherche. Il exploitera l'approche V-SYNTHES, une stratégie innovante de découverte et de conception de nouvelles molécules thérapeutiques guidée par l'IA, afin de développer des inhibiteurs BET hautement puissants ciblant C. auris. Ces inhibiteurs seront caractérisés par des analyses biophysiques, biochimiques et cellulaires, étudiés en co-cristallographie avec leurs bromodomaines cibles, puis validés pour leur activité spécifique dans C. auris ainsi que pour leur efficacité antifongique dans des modèles animaux d'infection. Ils serviront également à explorer les mécanismes d'émergence de la résistance aux inhibiteurs BET. Ce projet allie une stratégie antifongique originale à une approche méthodologique innovante, offrant un cadre de formation unique à la recherche interdisciplinaire et translationnelle.
Université / école doctorale
Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
Master's
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2026
Personne à contacter par le candidat
PETOSA Carlo < email deleted for security reasons >
CNRS IBS
DRF/IRIG/DBSCI/IBS/EPIGEN
Institut de biologie structurale
Groupe 'Épigénétique et voies moléculaires'
71 Avenue des Martyrs, CS10090
38044 Grenoble cedex 9
0457428617
Tuteur / Responsable de thèse
PETOSA Carlo < email deleted for security reasons >
CNRS IBS
DRF/IRIG/DBSCI/IBS/EPIGEN
Institut de biologie structurale
Groupe 'Épigénétique et voies moléculaires'
71 Avenue des Martyrs, CS10090
38044 Grenoble cedex 9
0457428617
En savoir plus
https://www.ibs.fr/en/research/assembly-dynamics-and-reactivity/epigenetics-and-molecular-pathways-group-c-petosa
